میکروب ها: نگاه کن، گوش کن و بگو

وقتی به رفتن به یک کنفرانس علمی فکر می کنید، ممکن است به این فکر کنید که تمام روز در میان دریایی از صندلی ها بنشینید و به سخنرانی گوش دهید. اما نه، نه در جلسه میکروب 2018 انجمن میکروبیولوژی آمریکا. بلافاصله پس از ورودم، داشتم از طریق یک میکروسکوپ کاغذی، مقرون به صرفه و قابل حمل به نام " فولدسکوپ " نگاه می کردم. همانجا روی زمین بیرون سالن سخنرانی.

وقتی دکتر پراکاش چند فولدسکوپ بیرون آورده بود و یک کارگاه اصلاحی برگزار کرده بود، دیدن "علمی" موقتی فوق العاده بود . این میکروسکوپ‌های کاغذی مانند میکروسکوپ‌های معمولی کار می‌کنند و کیفیت نوری مشابهی دارند.

من ساعت ها در یک اتاق تاریک با یک میکروسکوپ کانفوکال کار کرده ام، با این حال بار دیگر مجذوب دنیایی شدم که با نگاه کردن به یک میکروسکوپ نازک و بسیار قابل حمل کاغذی خود را نشان می دهد. مسلماً فلورسانس کمتری دارد، اما هنوز هم بسیار زیبا! فعال کردن دانشمند در همه - همه جا!

از «نگاه کردن» تا «گوش دادن» به میکروب ها
اما دیدن میکروب ها از طریق میکروسکوپ تنها راه تجسم آنها نیست. شما همچنین می توانید آنها را "شنوید". دکتر میخائیل شاپیرو ، سپرده گذار Addgene از کلتک، روشی هیجان انگیز برای گوش دادن به میکروب ها با استفاده از روش های غیرتهاجمی برای تصویربرداری سلولی با سونوگرافی ارائه کرد . او در تحقیقات خود از «دستگاه‌های شناور مولکولی» باکتریایی (که به عنوان وزیکول‌های گاز نیز شناخته می‌شوند) به عنوان رنگ‌های مبتنی بر مولکول زیستی آکوستیک استفاده می‌کند. این فناوری به طور گسترده قابل استفاده است زیرا بیان باکتریایی رنگ ها امکان تجسم رنگ را در داخل بدن با استفاده از اولتراسوند فراهم می کند (برای مثال به شکل زیر مراجعه کنید). علاوه بر هزینه کم، نفوذ به عمق بافت و وضوح فضایی بالا از مزایای این تکنیک است. حتی می توان رنگ های اولتراسوند را مالتیپلکس کرد زیرا این رنگ ها در فرکانس های مختلف اولتراسوند "در هم می ریزند". در وبلاگ ما درباره " استفاده از امواج فراصوت برای تصویربرداری از باکتری ها در داخل بدن: ژن های گزارشگر صوتی " بیشتر بخوانید.

رویکردهای خلاقانه برای ارائه دنیای میکروبی

پس از یادگیری در مورد استفاده از صدا برای تجسم باکتری ها در آزمایشگاه باکتری شناسی، من برای یادگیری در مورد رویکردهای خلاقانه برای تجسم باکتری ها در یک محیط آموزشی هیجان زده شدم. سمپوزیوم "رویکردهای خلاقانه برای ارائه دنیای میکروبی" ارتباطات و ایده های پیچیده ای را در رویکردهای تجسمی مختلف از کمیک های دستی (دکتر سانجا سافتیک) تا گیف های آموزشی ایجاد شده توسط خواهران آمیب به نمایش گذاشت . در اینجا یک مثال از نحوه "پر کردن شکاف اصطلاحات با استفاده از GIF" آورده شده است:

 پیام به خانه این بود که خلاق بودن و داستان گفتن موضوعات علمی را هم جالب و هم قابل دسترس می کند!  

فینال بزرگ تأثیرات بصری توسط برندگان هنر ASM Agar ارائه شد ! دیدن هنر زنده ای که توسط ذهن های خلاق با دستی بسیار ثابت (من فرض می کنم) طراحی شده، کاملاً شگفت انگیز است. با اتصال هنر و علم، یک رابط جذاب ایجاد می شود که بارهای الهام برای میکروبیولوژیست های فعلی و نسل بعدی ایجاد می کند.

اگر برای تولید هنر آگار خود الهام گرفته اید، به منابع میکروبیولوژی و پروتئین فلورسنت ما نگاهی بیندازید و شروع کنید! 

من چیزهای زیادی در مورد راه‌های خلاقانه برای برقراری ارتباط علمی و اطلاع‌رسانی آموختم - اگر می‌خواهید درباره ارتباطات علمی بیشتر بدانید، این پست‌های وبلاگ SciComm را ببینید

از کفیر تا کیوی: کشف اکتشافات میکروبی جدید

انجمن میکروبیولوژی هر ماه  مجله بین المللی میکروبیولوژی سیستماتیک و تکاملی را منتشر می کند که به جزئیات گونه های تازه کشف شده باکتری ها، قارچ ها و پروتیست ها می پردازد. در اینجا برخی از گونه های جدید کشف شده و مکان هایی که آنها پیدا شده اند آورده شده است.

اولین توقف ما در «جدید به علم» این ماه یک ضربه دوگانه است: دو گونه جدید باکتری از نمونه‌های خاک در یارو راسمن در کوه‌های الزورث (یونیون یخچال، قطب جنوب) شناسایی شده‌اند. Rhodococcus navarretei و Pseudarthrobacter quantipunctorum برخی از میکروب‌های جدید هیجان‌انگیز هستند زیرا توانایی بیوسنتز نانوذرات فلورسنت را دارند. توانایی آن‌ها در بیوسنتز نانوذرات سولفید کادمیوم، آن‌ها را به میکروارگانیسم‌های امیدوارکننده‌ای برای اهداف بیوتکنولوژیکی تبدیل می‌کند و اهمیت محیط‌های کمتر کاوش‌شده، مانند قطب جنوب، را به عنوان منبع برجسته می‌کند.

 کوه های نواح جان کاتز در رشته کوه الزورث، قطب جنوب.
در مرحله بعد، ما دو گونه از باکتری ها را داریم که در کفیر آب یافت می شوند، یک نوشیدنی تخمیر شده که از آب و دانه های کفیر آب تهیه می شود. گونه‌های جدید ما طی مطالعه‌ای که نمونه‌های کفیر آب به‌دست‌آمده از کشورهای مختلف را تجزیه و تحلیل می‌کرد، جدا شدند. آنها Bifidobacterium fermentum و  Bifidobacterium aquikefiricola نام دارند . Fermentum یعنی چیزی که باعث تخمیر می شود و aquikefiricola یعنی کفیر آب ساکن.

بیایید به ویژگی مشترک «جدید به علم» برای میکروب بعدی خود برگردیم. Paracoccus actinidiae یک باکتری جدید است که از خاک ریزوسفر درخت کیوی جدا شده است. خاک‌های ریزوسفر درختان کیوی دارای انواع غنی از میکروارگانیسم‌ها هستند که نقش‌های اساسی در ترویج رشد گیاه، محافظت در برابر عوامل بیماری‌زا و بهبود سلامت خاک دارند، بنابراین می‌تواند کاربردهای بالقوه‌ای هیجان‌انگیز در کشاورزی داشته باشد. در حالی که بسیار عالی بود اگر کلنی‌ها درست مانند ریشه‌های میوه‌ای‌شان گرد و سبز به نظر می‌رسیدند، اما در واقع گرد و نارنجی رنگ، با سطوح محدب، صاف و لبه‌های کاملاً مشخص بودند.

میکروب بعدی ما از یک اسفنج دریایی Diacarnus erythraeanus جدا شد . این باکتری جدید متعلق به جنس Microbulbifer، تنها جنس از خانواده Microbulbiferaceae است و به درستی Microbulbifer spongiae نامیده شده است . عجیب نیست که میکروب جدیدی از یک اسفنج دریایی کشف شده است، زیرا آنها منبع با ارزشی از میکروب ها و باکتری های جدید مرتبط با اسفنج های دریایی از جمله منبع جالب ترکیبات زیست فعال جدید با پتانسیل های بیوتکنولوژیکی هستند.

ما عاشق برجسته کردن گونه های مخمر جدید کشف شده در "New to Science" هستیم، بنابراین اجازه دهید یکی از آنها را تمام کنیم. میکروب نهایی ما، Yamadazyma thunbergiae ، یک گونه مخمر جدید است که با انگور و خاک ساعت بنگال در ژاپن مرتبط است. انگور قفلی بنگال یا Thunbergia grandiflora یک گونه غیر بومی است که در طبیعت در جزیره زیبای اوکیناوا ژاپن می روید. مخمر ما به گونه های متنوع Yamadazyma می پیوندد که در گیاهان، حشرات، خاک، آب، مواد معدنی و زیستگاه های جوی یافت می شود.

 بهترین کتاب میکروبیولوژی پزشکی